根據涂層的分子結構，煙囪防腐涂層可分為三種類型，即低分子球形結構的涂層膜、線性分子結構的涂層膜和完整的網狀分子結構的涂層膜。
1.低分子球形結構的涂層膜：低分子球形結構的涂層由大量球形或類似的球形低分子(如紫膠、松香衍生物等)組成，彈性較低。大多數的水是不耐水的，耐熱的，并且不能抵抗大氣的入侵和。
2.線性分子結構的涂層膜：一個線性分子結構的涂層膜是由線型或支化鏈型大分子(如硝酸纖維)和多個非轉換型合成樹脂(如四氯乙烯、聚丙烯等)組成的。這種涂層相互交織，緊密接觸，彈性、耐磨性、耐水性、耐熱性等都比低分子結構的高。
3.體型網狀分子結構的涂膜。一種屬于整體式網狀分子結構的涂膜，涂層上涂有聚酯、丙烯酸、聚氨酯等涂膜，分子之間有多條側鏈緊密相連，從而使涂膜的耐水性、耐候性、耐熱性、抗寒性、耐磨性、耐化學性和類似性均高于其它兩種分子結構，這是由于側鏈較強的兩種分子結構所致。